花椒用作中药，有温中行气、逐寒、止痛、杀虫等功效。治胃腹冷痛、呕吐、泄泻、血吸虫、蛔虫等症。又作表皮麻醉剂。
古代人认为花椒的香气可辟邪，有些朝代的宫廷，用花椒渗入涂料以糊墙壁，这种房子称为“椒房’，是给宫女住的。后来就以椒房比喻宫女后妃
花椒的功效主要是上寒止痛，止痒等作用，花椒在生活中也是比较常见的一种调味料，而且烹饪的时候加入一些花椒可以达到去腥的效果，花椒分为两种，一种是藤椒，一种是麻椒，但是吃花椒的时候最好不要多吃，如果多吃，可能会导致上火，肠道刺激的人最好不要吃花椒。
花椒泡脚去湿气。另主要取花椒燥湿杀虫、止痒的功效，借助泡脚疗法使花椒有效成分更好的被皮肤吸收，增强其疗效。中医药学认为，花椒味辛、性温，归脾、胃、肾经，即可内服，也可外用。内服常用于饮食积滞、心腹冷痛、呕吐、噫呃、咳嗽气逆、泄泻、痢疾、疝痛、水肿、风寒湿痹、蛔虫病、蛲虫病等。外用可用于牙痛、阴痒，疮疥、手足癣、脚气等。现代药理研究，花椒可消炎镇痛，有较强的抑菌作用，对羊毛样小孢子菌和红色毛癣菌作用最强，对多种皮肤癣菌和深部真菌都有抑制和杀灭作用。因此花椒泡脚是治疗脚癣、脚气、足痛的有效方法之一。